Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCINQ13939 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCINQ13939 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCINQ13939 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCINQ13939 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCINQ13939 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCINQ13939 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCINQ13939 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCINQ13939 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCINQ13939 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCINQ13939 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCINQ13939 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCINQ13939 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCINQ13939 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCINQ13939 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCINQ13939 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCINQ13939 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCINQ13939 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCINQ13939 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCINQ13939 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCINQ13939 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCINQ13939 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCINQ13939 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCINQ13939 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCINQ13939 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCINQ13939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCINQ13939 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCINQ13939 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCINQ13939 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCINQ13939 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCINQ13939 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCINQ13939 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCINQ13939 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCINQ13939 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCINQ13939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCINQ13939 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCINQ13939 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCINQ13939 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCINQ13939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCINQ13939 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCINQ13939 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCINQ13939 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCINQ13939 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCINQ13939 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCINQ13939 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCINQ13939 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCINQ13939 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCINQ13939 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCINQ13939 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCINQ13939 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCINQ13939 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCINQ13939 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCINQ13939 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCINQ13939 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCINQ13939 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCINQ13939 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCINQ13939 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCINQ13939 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCINQ13939 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCINQ13939 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCINQ13939 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCINQ13939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCINQ13939 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCINQ13939 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCINQ13939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCINQ13939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCINQ13939 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCINQ13939 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCINQ13939 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCINQ13939 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCINQ13939 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCINQ13939 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCINQ13939 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCINQ13939 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCINQ13939 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCINQ13939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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