Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF9Q13886 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF9Q13886 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF9Q13886 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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