Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAMK2BQ13554 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAMK2BQ13554 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAMK2BQ13554 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMK2BQ13554 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2BQ13554 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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