Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms