Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRQ13535 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRQ13535 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRQ13535 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRQ13535 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRQ13535 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRQ13535 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRQ13535 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRQ13535 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRQ13535 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRQ13535 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRQ13535 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRQ13535 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRQ13535 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms