Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SERINC3Q13530 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SERINC3Q13530 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SERINC3Q13530 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERINC3Q13530 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERINC3Q13530 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms