Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTM1Q13496 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTM1Q13496 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MTM1Q13496 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTM1Q13496 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTM1Q13496 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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