Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTB2Q13425 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTB2Q13425 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTB2Q13425 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB2Q13425 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB2Q13425 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms