Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDE3BQ13370 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDE3BQ13370 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDE3BQ13370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDE3BQ13370 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
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