Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA3BQ13214 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3BQ13214 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3BQ13214 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SEMA3BQ13214 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3BQ13214 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms