Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A2Q13183 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A2Q13183 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC13A2Q13183 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A2Q13183 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A2Q13183 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms