Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RLFQ13129 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLFQ13129 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLFQ13129 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RLFQ13129 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLFQ13129 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLFQ13129 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLFQ13129 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RLFQ13129 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLFQ13129 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RLFQ13129 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RLFQ13129 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RLFQ13129 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RLFQ13129 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RLFQ13129 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RLFQ13129 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RLFQ13129 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RLFQ13129 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLFQ13129 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLFQ13129 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RLFQ13129 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLFQ13129 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RLFQ13129 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RLFQ13129 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLFQ13129 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLFQ13129 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RLFQ13129 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RLFQ13129 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RLFQ13129 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RLFQ13129 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RLFQ13129 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RLFQ13129 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RLFQ13129 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLFQ13129 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLFQ13129 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RLFQ13129 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLFQ13129 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLFQ13129 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RLFQ13129 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLFQ13129 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLFQ13129 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLFQ13129 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RLFQ13129 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RLFQ13129 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RLFQ13129 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RLFQ13129 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLFQ13129 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RLFQ13129 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLFQ13129 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLFQ13129 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLFQ13129 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLFQ13129 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RLFQ13129 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RLFQ13129 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RLFQ13129 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLFQ13129 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLFQ13129 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLFQ13129 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RLFQ13129 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLFQ13129 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLFQ13129 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RLFQ13129 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RLFQ13129 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RLFQ13129 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLFQ13129 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLFQ13129 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLFQ13129 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLFQ13129 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLFQ13129 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLFQ13129 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RLFQ13129 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RLFQ13129 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLFQ13129 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLFQ13129 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RLFQ13129 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RLFQ13129 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLFQ13129 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLFQ13129 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLFQ13129 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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