Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT88Q13099 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT88Q13099 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFT88Q13099 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT88Q13099 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT88Q13099 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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