Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL28Q13084 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL28Q13084 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL28Q13084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL28Q13084 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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