Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC16Q13042 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC16Q13042 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC16Q13042 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC16Q13042 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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