Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC45.57■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
PRDM2Q13029 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
PRDM2Q13029 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PRDM2Q13029 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
PRDM2Q13029 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
PRDM2Q13029 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
PRDM2Q13029 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
PRDM2Q13029 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
PRDM2Q13029 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PRDM2Q13029 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
PRDM2Q13029 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
PRDM2Q13029 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
PRDM2Q13029 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
PRDM2Q13029 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
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