Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX10Q12887 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX10Q12887 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX10Q12887 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX10Q12887 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX10Q12887 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX10Q12887 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COX10Q12887 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COX10Q12887 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX10Q12887 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX10Q12887 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX10Q12887 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX10Q12887 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX10Q12887 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX10Q12887 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX10Q12887 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX10Q12887 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX10Q12887 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX10Q12887 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX10Q12887 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX10Q12887 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX10Q12887 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX10Q12887 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX10Q12887 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX10Q12887 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX10Q12887 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX10Q12887 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX10Q12887 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX10Q12887 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX10Q12887 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX10Q12887 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX10Q12887 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX10Q12887 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX10Q12887 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX10Q12887 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX10Q12887 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COX10Q12887 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX10Q12887 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX10Q12887 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX10Q12887 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX10Q12887 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX10Q12887 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX10Q12887 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX10Q12887 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX10Q12887 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX10Q12887 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX10Q12887 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX10Q12887 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX10Q12887 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX10Q12887 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX10Q12887 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX10Q12887 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX10Q12887 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX10Q12887 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX10Q12887 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX10Q12887 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX10Q12887 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX10Q12887 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX10Q12887 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX10Q12887 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX10Q12887 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX10Q12887 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX10Q12887 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX10Q12887 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX10Q12887 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX10Q12887 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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