Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 UBC5YDR059C 447 nt10.55□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 YHR022CYHR022C 771 nt10.55□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 NMD4YLR363C 657 nt10.55□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 DSC2YOL073C 969 nt10.55□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 MGR3YMR115W 1506 nt10.54□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 YDL121CYDL121C 450 nt10.54□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 MMS21YEL019C 804 nt10.54□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 ALG12YNR030W 1656 nt10.53□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 PEX22YAL055W 543 nt10.53□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 ARL3YPL051W 597 nt10.53□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 RMD5YDR255C 1266 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 RPI1YIL119C 1224 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 PCD1YLR151C 1023 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YNL171CYNL171C 369 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 ISA2YPR067W 558 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 DPS1YLL018C 1674 nt10.52□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YDR220CYDR220C 294 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 SPO16YHR153C 597 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YLR118CYLR118C 684 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YAR028WYAR028W 705 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 GCN5YGR252W 1320 nt10.51□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 RRP17YDR412W 708 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 MTC7YEL033W 420 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 IBD2YNL164C 1056 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 SLZ1YNL196C 897 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YNL228WYNL228W 777 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 ADH1YOL086C 1047 nt10.5□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 CWC15YDR163W 528 nt10.49□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 ADK2YER170W 678 nt10.49□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YLR349WYLR349W 507 nt10.49□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 GTR1YML121W 933 nt10.49□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 BTS1YPL069C 1008 nt10.49□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YLR202CYLR202C 327 nt10.48□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 DCP1YOL149W 696 nt10.48□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 SLM4YBR077C 489 nt10.48□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 ALP1YNL270C 1722 nt10.47□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 POP6YGR030C 477 nt10.47□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 PRM5YIL117C 957 nt10.47□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt10.47□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 ATG17YLR423C 1254 nt10.47□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 NBP2YDR162C 711 nt10.46□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 MRS3YJL133W 945 nt10.46□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 YNR029CYNR029C 1290 nt10.46□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 FES1YBR101C 873 nt10.46□□□□□ -0.73
NCR1Q12200 GND1YHR183W 1470 nt10.46□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 SNF1YDR477W 1902 nt10.45□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YER147C-AYER147C-A 411 nt10.45□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 COX16YJL003W 357 nt10.45□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 AKR2YOR034C 2250 nt10.45□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 NSA1YGL111W 1392 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 ENT5YDR153C 1236 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 COX2Q0250 756 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 LYS12YIL094C 1116 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 FUN14YAL008W 597 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YJR154WYJR154W 1041 nt10.43□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 LOT5YKL183W 921 nt10.43□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 CMS1YLR003C 876 nt10.43□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YOR105WYOR105W 327 nt10.43□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YJL195CYJL195C 702 nt10.42□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 BMT6YLR063W 1098 nt10.42□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 ERV41YML067C 1059 nt10.42□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 STE4YOR212W 1272 nt10.42□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 FCY21YER060W 1587 nt10.42□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 MHO1YJR008W 1017 nt10.41□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt10.41□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 AAC1YMR056C 930 nt10.4□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YBR134WYBR134W 402 nt10.4□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 PAB1YER165W 1734 nt10.4□□□□□ -0.74
NCR1Q12200 YDL119CYDL119C 924 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 APT2YDR441C 546 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 YPI1YFR003C 468 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 COG2YGR120C 789 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 IRC24YIR036C 792 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 SMM1YNR015W 1155 nt10.39□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 RPC53YDL150W 1269 nt10.38□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 UGA4YDL210W 1716 nt10.38□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 FAF1YIL019W 1041 nt10.37□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 TRP4YDR354W 1143 nt10.36□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 YFR057WYFR057W 456 nt10.36□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 ARG3YJL088W 1017 nt10.36□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 MIX17YMR002W 471 nt10.36□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt10.36□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt10.35□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 DDI1YER143W 1287 nt10.35□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 PUS5YLR165C 765 nt10.35□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 RUF20RUF20 443 nt10.35□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 DBP1YPL119C 1854 nt10.35□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 UBS1YBR165W 834 nt10.34□□□□□ -0.75
NCR1Q12200 RRP1YDR087C 837 nt10.33□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 YPR177CYPR177C 372 nt10.33□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 SED1YDR077W 1017 nt10.32□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 RAI1YGL246C 1164 nt10.32□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 SWP1YMR149W 861 nt10.32□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 BAG7YOR134W 1230 nt10.32□□□□□ -0.76
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