Protein–RNA interactions for Protein: Q12163

NBP2, NAP1-binding protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NBP2Q12163 YMR007WYMR007W 381 nt8.69□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 SNX3YOR357C 489 nt8.69□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 VBA3YCL069W 1377 nt8.69□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 RPD3YNL330C 1302 nt8.68□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 ERO1YML130C 1692 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 YLR280CYLR280C 351 nt8.66□□□□□ -1.02
NBP2Q12163 POP2YNR052C 1302 nt8.64□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 RCR1YBR005W 642 nt8.64□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 HEL2YDR266C 1920 nt8.64□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 SAN1YDR143C 1833 nt8.64□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 YGR210CYGR210C 1236 nt8.63□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 YMR209CYMR209C 1374 nt8.62□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 YPT11YNL304W 1254 nt8.62□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 MET8YBR213W 825 nt8.62□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.61□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 FCY1YPR062W 477 nt8.61□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 RIM2YBR192W 1134 nt8.61□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 KGD2YDR148C 1392 nt8.61□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 SSL2YIL143C 2532 nt8.6□□□□□ -1.03
NBP2Q12163 CWP2YKL096W-A 279 nt8.58□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 ODC1YPL134C 933 nt8.58□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 KRR1YCL059C 951 nt8.56□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 YFR020WYFR020W 699 nt8.56□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 SBP1YHL034C 885 nt8.56□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 YPL108WYPL108W 507 nt8.56□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 GAS1YMR307W 1680 nt8.56□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 RSM7YJR113C 744 nt8.55□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 RPC31YNL151C 756 nt8.55□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 PTC6YCR079W 1329 nt8.54□□□□□ -1.04
NBP2Q12163 DMA2YNL116W 1569 nt8.51□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 YDR306CYDR306C 1437 nt8.5□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 BUD20YLR074C 501 nt8.5□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 MCM5YLR274W 2328 nt8.49□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 YJL160CYJL160C 864 nt8.49□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 DPL1YDR294C 1770 nt8.48□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 YMR166CYMR166C 1107 nt8.48□□□□□ -1.05
NBP2Q12163 MDM35YKL053C-A 261 nt8.46□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 LSP1YPL004C 1026 nt8.46□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 MAE1YKL029C 2010 nt8.46□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 PSD1YNL169C 1503 nt8.45□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 GRH1YDR517W 1119 nt8.45□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 EMC3YKL207W 762 nt8.45□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YLR460CYLR460C 1131 nt8.45□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 GGA2YHR108W 1758 nt8.44□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 PAU21YOR394W 495 nt8.44□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 PAU22YPL282C 495 nt8.44□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YMR210WYMR210W 1350 nt8.44□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.42□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YOR343CYOR343C 327 nt8.42□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 THI3YDL080C 1830 nt8.42□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YHR218WYHR218W 1812 nt8.41□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 PET18YCR020C 648 nt8.41□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 RSC4YKR008W 1878 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 YDR467CYDR467C 327 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 CHS7YHR142W 951 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 HRA1HRA1 564 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 GPM1YKL152C 744 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 CYT1YOR065W 930 nt8.4□□□□□ -1.06
NBP2Q12163 GID7YCL039W 2238 nt8.39□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 LEU4YNL104C 1860 nt8.38□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 CAK1YFL029C 1107 nt8.38□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 RRT14YIL127C 621 nt8.38□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 HXT10YFL011W 1641 nt8.38□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 MET2YNL277W 1461 nt8.38□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 OCH1YGL038C 1443 nt8.37□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 MET22YOL064C 1074 nt8.37□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 MRP1YDR347W 966 nt8.35□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 MFT1YML062C 1179 nt8.35□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 RPL12BYDR418W 498 nt8.34□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 OLA1YBR025C 1185 nt8.34□□□□□ -1.07
NBP2Q12163 PDC6YGR087C 1692 nt8.34□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 HEM14YER014W 1620 nt8.33□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YER156CYER156C 1017 nt8.33□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YIR035CYIR035C 765 nt8.33□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.33□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 ADA2YDR448W 1305 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 INH1YDL181W 258 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 UTR5YEL035C 501 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YBL095WYBL095W 813 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 AAC3YBR085W 924 nt8.32□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 TMS1YDR105C 1422 nt8.31□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 GDH1YOR375C 1365 nt8.31□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 SFP1YLR403W 2052 nt8.31□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 AGP3YFL055W 1677 nt8.3□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 RNA170RNA170 169 nt8.3□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YPR084WYPR084W 1371 nt8.3□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 PUS7YOR243C 2031 nt8.3□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 RPS6AYPL090C 711 nt8.29□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YMC2YBR104W 990 nt8.29□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 RPS6BYBR181C 711 nt8.29□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 NPP1YCR026C 2229 nt8.29□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 BXI1YNL305C 894 nt8.28□□□□□ -1.08
NBP2Q12163 YRF1-2YER190W 5046 nt8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms