Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.77□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.77□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.77□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.77□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 LSR1LSR1 1175 nt8.77□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 MCM5YLR274W 2328 nt8.76□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 MAS1YLR163C 1389 nt8.76□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 RPN14YGL004C 1254 nt8.75□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 PCP1YGR101W 1041 nt8.75□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 CYT1YOR065W 930 nt8.74□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 snR31snR31 225 nt8.74□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 ENO1YGR254W 1314 nt8.74□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 YMR265CYMR265C 1386 nt8.73□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 HAP5YOR358W 729 nt8.73□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 CWP2YKL096W-A 279 nt8.72□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 SNX3YOR357C 489 nt8.72□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 HXK1YFR053C 1458 nt8.71□□□□□ -1.01
SPE3Q12074 NAM8YHR086W 1572 nt8.71□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 DMA2YNL116W 1569 nt8.71□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 YLR280CYLR280C 351 nt8.71□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 KRR1YCL059C 951 nt8.7□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 SSL2YIL143C 2532 nt8.7□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 YRF1-2YER190W 5046 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 YGR210CYGR210C 1236 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 SRP102YKL154W 735 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 YOR343CYOR343C 327 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 ODC1YPL134C 933 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 ALD5YER073W 1563 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 ERO1YML130C 1692 nt8.69□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 SUV3YPL029W 2214 nt8.68□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 SWT21YNL187W 1074 nt8.68□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 GRH1YDR517W 1119 nt8.67□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 HRA1HRA1 564 nt8.67□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 SDS24YBR214W 1584 nt8.66□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.66□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 RIM2YBR192W 1134 nt8.66□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 RPL12BYDR418W 498 nt8.65□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 PAU21YOR394W 495 nt8.65□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 PAU22YPL282C 495 nt8.65□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 MET1YKR069W 1782 nt8.65□□□□□ -1.02
SPE3Q12074 RPC31YNL151C 756 nt8.64□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 SFL1YOR140W 2301 nt8.64□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 HEM14YER014W 1620 nt8.63□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 CRC1YOR100C 984 nt8.63□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 MDM35YKL053C-A 261 nt8.62□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 REX2YLR059C 810 nt8.62□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 YHR218WYHR218W 1812 nt8.61□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 YKL053WYKL053W 375 nt8.59□□□□□ -1.03
SPE3Q12074 EMC3YKL207W 762 nt8.58□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 VBA3YCL069W 1377 nt8.58□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 YPL108WYPL108W 507 nt8.57□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 SRP54YPR088C 1626 nt8.57□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 DTR1YBR180W 1719 nt8.56□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 KGD2YDR148C 1392 nt8.54□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 YOR072WYOR072W 315 nt8.54□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 YOR268CYOR268C 399 nt8.54□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 SBP1YHL034C 885 nt8.53□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 DPL1YDR294C 1770 nt8.53□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 SAN1YDR143C 1833 nt8.52□□□□□ -1.04
SPE3Q12074 YMR210WYMR210W 1350 nt8.52□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 LSP1YPL004C 1026 nt8.52□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 ILV2YMR108W 2064 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 INH1YDL181W 258 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 MRP1YDR347W 966 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 YJL160CYJL160C 864 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 RSM7YJR113C 744 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 YPT11YNL304W 1254 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 RSC4YKR008W 1878 nt8.51□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 YDR467CYDR467C 327 nt8.49□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 YDR306CYDR306C 1437 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 GAS1YMR307W 1680 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 Q0010Q0010 387 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 GTB1YDR221W 2109 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 HXT10YFL011W 1641 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 LEU4YNL104C 1860 nt8.47□□□□□ -1.05
SPE3Q12074 YFR020WYFR020W 699 nt8.46□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 KAE1YKR038C 1161 nt8.46□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 MFT1YML062C 1179 nt8.46□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 GGA2YHR108W 1758 nt8.45□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 YMR166CYMR166C 1107 nt8.45□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 PTC6YCR079W 1329 nt8.45□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 GPM1YKL152C 744 nt8.44□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 MEX67YPL169C 1800 nt8.43□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 YLR460CYLR460C 1131 nt8.43□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 MFG1YDL233W 1377 nt8.43□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 GDH1YOR375C 1365 nt8.43□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 SDH8YBR269C 417 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 MDL2YPL270W 2322 nt8.41□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 AGP3YFL055W 1677 nt8.4□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.4□□□□□ -1.06
SPE3Q12074 MTO1YGL236C 2010 nt8.39□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 THI3YDL080C 1830 nt8.39□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 PET18YCR020C 648 nt8.39□□□□□ -1.07
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