Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC173Q0VFZ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC173Q0VFZ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms