Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD300CQ08708 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD300CQ08708 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD300CQ08708 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms