Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RELQ04864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELQ04864 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELQ04864 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELQ04864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELQ04864 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELQ04864 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELQ04864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELQ04864 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELQ04864 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELQ04864 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELQ04864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELQ04864 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELQ04864 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELQ04864 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELQ04864 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RELQ04864 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELQ04864 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELQ04864 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELQ04864 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELQ04864 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELQ04864 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RELQ04864 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELQ04864 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELQ04864 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELQ04864 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELQ04864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELQ04864 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELQ04864 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELQ04864 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELQ04864 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELQ04864 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELQ04864 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELQ04864 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELQ04864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELQ04864 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELQ04864 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELQ04864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELQ04864 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELQ04864 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELQ04864 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELQ04864 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELQ04864 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELQ04864 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELQ04864 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELQ04864 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELQ04864 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELQ04864 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELQ04864 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELQ04864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELQ04864 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELQ04864 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELQ04864 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELQ04864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELQ04864 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELQ04864 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELQ04864 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELQ04864 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELQ04864 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELQ04864 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELQ04864 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELQ04864 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELQ04864 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELQ04864 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELQ04864 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELQ04864 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELQ04864 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RELQ04864 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RELQ04864 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RELQ04864 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RELQ04864 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RELQ04864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RELQ04864 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RELQ04864 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RELQ04864 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RELQ04864 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RELQ04864 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RELQ04864 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RELQ04864 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RELQ04864 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RELQ04864 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms