Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POU5F1Q01860 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POU5F1Q01860 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POU5F1Q01860 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POU5F1Q01860 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POU5F1Q01860 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POU5F1Q01860 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms