Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYBPC1Q00872 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYBPC1Q00872 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYBPC1Q00872 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYBPC1Q00872 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms