Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB2Q00653 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKB2Q00653 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKB2Q00653 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB2Q00653 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB2Q00653 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms