Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK6Q00534 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK6Q00534 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK6Q00534 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms