Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPCAP84074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPCAP84074 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPCAP84074 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPCAP84074 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HPCAP84074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPCAP84074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPCAP84074 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPCAP84074 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPCAP84074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPCAP84074 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPCAP84074 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPCAP84074 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPCAP84074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPCAP84074 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPCAP84074 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPCAP84074 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPCAP84074 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPCAP84074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPCAP84074 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPCAP84074 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPCAP84074 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPCAP84074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPCAP84074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPCAP84074 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPCAP84074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPCAP84074 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HPCAP84074 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPCAP84074 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPCAP84074 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPCAP84074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPCAP84074 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPCAP84074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HPCAP84074 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPCAP84074 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPCAP84074 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPCAP84074 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPCAP84074 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPCAP84074 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPCAP84074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HPCAP84074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPCAP84074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPCAP84074 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPCAP84074 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPCAP84074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPCAP84074 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPCAP84074 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPCAP84074 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPCAP84074 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPCAP84074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPCAP84074 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPCAP84074 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPCAP84074 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPCAP84074 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPCAP84074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPCAP84074 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAP84074 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAP84074 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAP84074 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAP84074 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAP84074 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAP84074 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAP84074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAP84074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAP84074 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAP84074 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAP84074 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAP84074 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAP84074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAP84074 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAP84074 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms