Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COG7P83436 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COG7P83436 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG7P83436 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG7P83436 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG7P83436 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG7P83436 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COG7P83436 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG7P83436 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG7P83436 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG7P83436 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG7P83436 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG7P83436 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG7P83436 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG7P83436 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG7P83436 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG7P83436 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG7P83436 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG7P83436 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG7P83436 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COG7P83436 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG7P83436 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG7P83436 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG7P83436 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG7P83436 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG7P83436 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG7P83436 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COG7P83436 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COG7P83436 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COG7P83436 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG7P83436 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG7P83436 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG7P83436 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG7P83436 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG7P83436 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG7P83436 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG7P83436 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG7P83436 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG7P83436 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG7P83436 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG7P83436 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COG7P83436 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG7P83436 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG7P83436 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG7P83436 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG7P83436 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG7P83436 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COG7P83436 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG7P83436 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG7P83436 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG7P83436 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG7P83436 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG7P83436 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG7P83436 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG7P83436 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG7P83436 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG7P83436 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG7P83436 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG7P83436 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG7P83436 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG7P83436 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COG7P83436 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COG7P83436 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG7P83436 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG7P83436 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG7P83436 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG7P83436 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG7P83436 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG7P83436 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG7P83436 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG7P83436 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG7P83436 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG7P83436 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG7P83436 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG7P83436 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG7P83436 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG7P83436 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG7P83436 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG7P83436 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG7P83436 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms