Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX5P78411 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX5P78411 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX5P78411 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX5P78411 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX5P78411 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX5P78411 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX5P78411 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX5P78411 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IRX5P78411 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX5P78411 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX5P78411 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX5P78411 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX5P78411 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX5P78411 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX5P78411 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX5P78411 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX5P78411 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX5P78411 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX5P78411 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX5P78411 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX5P78411 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX5P78411 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms