Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT83P78385 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT83P78385 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT83P78385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT83P78385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT83P78385 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT83P78385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT83P78385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT83P78385 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT83P78385 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT83P78385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT83P78385 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT83P78385 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT83P78385 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT83P78385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT83P78385 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT83P78385 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT83P78385 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT83P78385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT83P78385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT83P78385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT83P78385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT83P78385 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT83P78385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT83P78385 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT83P78385 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT83P78385 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT83P78385 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT83P78385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT83P78385 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT83P78385 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT83P78385 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT83P78385 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT83P78385 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT83P78385 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT83P78385 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT83P78385 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT83P78385 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT83P78385 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT83P78385 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT83P78385 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT83P78385 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT83P78385 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT83P78385 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT83P78385 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT83P78385 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT83P78385 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT83P78385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT83P78385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT83P78385 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT83P78385 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT83P78385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT83P78385 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT83P78385 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT83P78385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT83P78385 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT83P78385 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT83P78385 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT83P78385 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT83P78385 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT83P78385 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT83P78385 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT83P78385 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT83P78385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT83P78385 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT83P78385 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT83P78385 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT83P78385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT83P78385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT83P78385 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT83P78385 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT83P78385 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT83P78385 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT83P78385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT83P78385 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT83P78385 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT83P78385 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms