Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTAG1AP78358 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTAG1AP78358 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTAG1AP78358 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTAG1AP78358 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms