Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTA1P68133 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTA1P68133 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTA1P68133 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTA1P68133 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms