Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC1P63316 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC1P63316 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNC1P63316 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC1P63316 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms