Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS29P62273 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS29P62273 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS29P62273 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS29P62273 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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