Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS29P62273 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS29P62273 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS29P62273 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPS29P62273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS29P62273 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS29P62273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS29P62273 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS29P62273 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS29P62273 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS29P62273 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS29P62273 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS29P62273 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS29P62273 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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