Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO4P61968 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO4P61968 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO4P61968 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO4P61968 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO4P61968 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO4P61968 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO4P61968 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO4P61968 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO4P61968 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO4P61968 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO4P61968 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO4P61968 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO4P61968 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO4P61968 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO4P61968 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO4P61968 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO4P61968 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO4P61968 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO4P61968 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO4P61968 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO4P61968 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO4P61968 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO4P61968 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO4P61968 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO4P61968 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO4P61968 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO4P61968 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO4P61968 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO4P61968 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO4P61968 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO4P61968 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO4P61968 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO4P61968 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO4P61968 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO4P61968 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO4P61968 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO4P61968 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO4P61968 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO4P61968 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO4P61968 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO4P61968 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO4P61968 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO4P61968 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO4P61968 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO4P61968 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO4P61968 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO4P61968 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO4P61968 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO4P61968 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO4P61968 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO4P61968 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO4P61968 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO4P61968 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO4P61968 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO4P61968 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO4P61968 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO4P61968 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO4P61968 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO4P61968 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO4P61968 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO4P61968 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO4P61968 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO4P61968 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO4P61968 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO4P61968 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO4P61968 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO4P61968 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO4P61968 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO4P61968 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO4P61968 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO4P61968 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO4P61968 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO4P61968 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO4P61968 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO4P61968 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO4P61968 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO4P61968 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms