Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UFM1P61960 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UFM1P61960 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UFM1P61960 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UFM1P61960 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UFM1P61960 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UFM1P61960 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UFM1P61960 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UFM1P61960 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UFM1P61960 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UFM1P61960 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UFM1P61960 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UFM1P61960 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UFM1P61960 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UFM1P61960 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UFM1P61960 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UFM1P61960 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UFM1P61960 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UFM1P61960 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFM1P61960 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFM1P61960 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFM1P61960 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFM1P61960 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFM1P61960 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFM1P61960 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFM1P61960 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFM1P61960 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFM1P61960 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UFM1P61960 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFM1P61960 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFM1P61960 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFM1P61960 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFM1P61960 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFM1P61960 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFM1P61960 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UFM1P61960 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UFM1P61960 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UFM1P61960 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UFM1P61960 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UFM1P61960 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UFM1P61960 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UFM1P61960 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UFM1P61960 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UFM1P61960 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UFM1P61960 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UFM1P61960 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UFM1P61960 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UFM1P61960 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UFM1P61960 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFM1P61960 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFM1P61960 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFM1P61960 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFM1P61960 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFM1P61960 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UFM1P61960 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFM1P61960 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFM1P61960 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UFM1P61960 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFM1P61960 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFM1P61960 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFM1P61960 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFM1P61960 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms