Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VBP1P61758 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VBP1P61758 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VBP1P61758 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VBP1P61758 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VBP1P61758 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VBP1P61758 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VBP1P61758 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VBP1P61758 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VBP1P61758 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VBP1P61758 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VBP1P61758 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VBP1P61758 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VBP1P61758 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VBP1P61758 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VBP1P61758 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VBP1P61758 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VBP1P61758 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VBP1P61758 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VBP1P61758 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VBP1P61758 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VBP1P61758 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VBP1P61758 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VBP1P61758 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VBP1P61758 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VBP1P61758 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VBP1P61758 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VBP1P61758 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VBP1P61758 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VBP1P61758 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VBP1P61758 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VBP1P61758 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VBP1P61758 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VBP1P61758 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VBP1P61758 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VBP1P61758 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VBP1P61758 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VBP1P61758 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VBP1P61758 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VBP1P61758 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VBP1P61758 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VBP1P61758 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VBP1P61758 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VBP1P61758 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VBP1P61758 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VBP1P61758 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VBP1P61758 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VBP1P61758 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VBP1P61758 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VBP1P61758 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VBP1P61758 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VBP1P61758 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VBP1P61758 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VBP1P61758 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VBP1P61758 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VBP1P61758 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VBP1P61758 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VBP1P61758 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VBP1P61758 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VBP1P61758 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VBP1P61758 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VBP1P61758 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VBP1P61758 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VBP1P61758 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VBP1P61758 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VBP1P61758 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VBP1P61758 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VBP1P61758 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VBP1P61758 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VBP1P61758 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VBP1P61758 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VBP1P61758 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VBP1P61758 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VBP1P61758 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VBP1P61758 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VBP1P61758 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VBP1P61758 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VBP1P61758 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VBP1P61758 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VBP1P61758 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VBP1P61758 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VBP1P61758 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VBP1P61758 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VBP1P61758 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VBP1P61758 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VBP1P61758 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VBP1P61758 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms