Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P61574 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P61574 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P61574 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P61574 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms