Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVS71-1P61550 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVS71-1P61550 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVS71-1P61550 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms