Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM258P61165 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM258P61165 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms