Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2KP61086 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2KP61086 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2KP61086 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms