Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX8P57073 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX8P57073 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX8P57073 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX8P57073 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX8P57073 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX8P57073 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX8P57073 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX8P57073 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX8P57073 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX8P57073 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX8P57073 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX8P57073 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX8P57073 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX8P57073 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX8P57073 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX8P57073 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX8P57073 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX8P57073 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX8P57073 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX8P57073 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX8P57073 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX8P57073 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX8P57073 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX8P57073 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX8P57073 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX8P57073 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX8P57073 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX8P57073 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX8P57073 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX8P57073 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX8P57073 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX8P57073 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX8P57073 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX8P57073 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX8P57073 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOX8P57073 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX8P57073 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX8P57073 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX8P57073 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX8P57073 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX8P57073 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX8P57073 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX8P57073 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX8P57073 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX8P57073 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX8P57073 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX8P57073 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX8P57073 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX8P57073 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX8P57073 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX8P57073 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX8P57073 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX8P57073 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX8P57073 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX8P57073 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX8P57073 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX8P57073 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX8P57073 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX8P57073 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX8P57073 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX8P57073 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX8P57073 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX8P57073 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX8P57073 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SOX8P57073 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOX8P57073 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX8P57073 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX8P57073 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX8P57073 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX8P57073 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX8P57073 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms