Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN20P56880 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN20P56880 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN20P56880 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN20P56880 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms