Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDDM3BP56851 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDDM3BP56851 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDDM3BP56851 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDDM3BP56851 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms