Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKNOX1P55347 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKNOX1P55347 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX1P55347 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX1P55347 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms