Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24CP53992 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24CP53992 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24CP53992 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24CP53992 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24CP53992 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24CP53992 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms