Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNP53814 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNP53814 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNP53814 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNP53814 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNP53814 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNP53814 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNP53814 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMTNP53814 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNP53814 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNP53814 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNP53814 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMTNP53814 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNP53814 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNP53814 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNP53814 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNP53814 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNP53814 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNP53814 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNP53814 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNP53814 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNP53814 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMTNP53814 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNP53814 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNP53814 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMTNP53814 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNP53814 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNP53814 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNP53814 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNP53814 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMTNP53814 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNP53814 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNP53814 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNP53814 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMTNP53814 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMTNP53814 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMTNP53814 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMTNP53814 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMTNP53814 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMTNP53814 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMTNP53814 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMTNP53814 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMTNP53814 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMTNP53814 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMTNP53814 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNP53814 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNP53814 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNP53814 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMTNP53814 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNP53814 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNP53814 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNP53814 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNP53814 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMTNP53814 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNP53814 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNP53814 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMTNP53814 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMTNP53814 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNP53814 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNP53814 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMTNP53814 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMTNP53814 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNP53814 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNP53814 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMTNP53814 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNP53814 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNP53814 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNP53814 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMTNP53814 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMTNP53814 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMTNP53814 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMTNP53814 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNP53814 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNP53814 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMTNP53814 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNP53814 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNP53814 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNP53814 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMTNP53814 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNP53814 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMTNP53814 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 921.2 ms