Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK2P53671 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK2P53671 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMK2P53671 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms