Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAP1GDS1P52306 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAP1GDS1P52306 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAP1GDS1P52306 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAP1GDS1P52306 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAP1GDS1P52306 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAP1GDS1P52306 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms